本发明涉及一种连铸机结晶器水的控制系统及方法，属于冶金技术领域。该系统包括具有水量扰动功能的结晶器水进水系统、结晶器系统和结晶器水出水系统；本发明的目的在于提供一种连铸机结晶器水的控制系统及方法，通过改变结晶器水在结晶器水缝内的流动形式，即从层流方式变为紊流方式，从而减少或消除结晶器冷却水在结晶器铜板面上的附面层，进而降低铜板和结晶器铜板间的热阻，以提升传热效果，提高坯壳在结晶器内的厚度和强度。方法简单，成本低廉，便于维护。