本发明公开了一种基于最大熵的极端水文事件风险分析方法和系统，属于水文学中的极端水文事件风险分析领域，包括：对采集的流域多年的实测流量值，使用年最大取样，得到长序列水文数据；将多种广义极值分布函数作为待选模型，对长序列水文数据进行拟合后对待选模型进行参数估计，得到待选模型的参数估计值，根据待选模型的参数估计值确定待选模型的概率密度分布函数；计算待选模型的概率密度分布函数的熵值，将熵值最大的待选模型作为最优模型；利用最优模型进行极端水文事件风险分析，得到流域百年一遇、千年一遇的设计洪水值。本发明不受限于所选模型概率密度函数参数数目、对于参数较多的模型可以给出相容估计、总是正确的选择最优分布。