本发明公开了一种在铝合金表面制备耐腐蚀超疏水膜层的方法，该方法首先用去离子水和乙醇在超声波清洗仪器中依次对预磨的铝合金基体进行清洗；对铝合金基体进行电解抛光、阳极氧化、扩孔处理；将基体放置在电化学镀镍液中，使基体表面获得凸包状织构，随后将基体放置在电化学镀钴装置中，进行电化学镀钴处理，通过以上步骤的处理，主要通过阳极氧化和电化学沉积相结合在基体表面构建花瓣状微纳米粗糙结构。最后将处理后的基体放入氟硅烷乙醇溶液中浸泡修饰降低其表面自由能，使铝合金表面获得耐腐蚀超疏水膜层，有效的提高了铝合金的耐蚀性。