本发明涉及电磁兼容测试领域，尤其涉及一种新能源汽车电机驱动系统的电磁兼容性能测试方法，包括以下步骤：1）将被测电机和电机控制器固定安装；2）将变速器的挡位切换至目标挡位；3）启动电磁兼容性能测试系统；4）获取测功机电机的实时转矩和转速，计算出被测电机的实时转矩和转速；5）对电磁兼容性能测试系统运行是否正常进行判断；6）电机控制器调控被测电机的实时转矩和转速，使被测电机的实时转矩和转速与被测电机的目标转矩和转速的相对误差均小于1%；7）进行电磁兼容性能测试。本方法可以检测新能源汽车启动、加速、刹车等驱动电机输出转速转矩变化的瞬态工况和平稳上坡、巡航等驱动电机输出转速转矩稳定的稳态工况下的电磁发射。