本申请提供一种发动机热管理系统及车辆，该系统包括发动机、废热换热器、电控阀和水泵，所述电控阀分别与所述发动机、所述水泵和所述废热换热器连通，所述发动机分别与所述水泵和所述废热换热器连通；所述发动机上设置有缸体水套和缸盖水套，所述缸盖水套与所述缸体水套并联设置，所述缸体水套与所述废热换热器串联设置；所述电控阀，用于控制所述缸体水套和所述缸盖水套中的流体流量的分配。本申请能够充分考虑缸体缸盖对于温度的精确需求，实现缸体部分对于温升以及高温的特殊需求，从而降低油耗排放。