本发明公开了一种富含GABA和花青素的芽菜的培育方法及其发酵乳饮料的制备方法，特点是培育方法包括步骤将紫花菜种子置于次氯酸钠溶液中浸泡用纯水冲洗，于含有2.7‑10.8 g/L葡萄糖和0.5‑1.5 g/L费菜总黄酮的混合溶液中浸泡沥干，然后于12/12h光照暗处理后，每天更换浸泡液，清洗芽菜沥干冷冻干燥粉碎，即得富含GABA和花青素的芽菜；发酵乳饮料制备方法包括以下步骤：将富含GABA和花青素的芽菜粉末与由小麦麦粒和玉米碎粒制备的含糖乳饮料等体积混合煮沸，超声波处理后过滤，取滤液加入植物乳杆菌菌悬液，装罐保温发酵后熟得富含GABA和花青素的发酵乳饮料，优点是γ‑氨基丁酸和花青素含量高。