本发明公开了一种黄原胶寡糖的制备方法，属于生物技术领域。本发明包括如下步骤：(1)配制黄原胶终浓度为1％的黄原胶‑酸溶液；(2)将离子液体加入到步骤(1)所得黄原胶溶液中，搅拌至黄原胶溶解，所得溶液中离子液体的终浓度为1mg/mL‑50mg/mL，将所得溶液在搅拌状态下进行反应；(3)反应完成后，将溶液pH调节至中性，而后过滤、滤液透析；透析结束后，进行冻干即可得到黄原胶寡糖。通过本发明的方法可制备出高活性的黄原胶寡糖，同时还提高了寡糖的产率，为黄原胶寡糖的工业化生产以及应用打下基础。