本发明属食品加工技术领域，为解决在黑枣的深度开发中黑枣果醋琥珀酸含量低，黑枣果醋品质差的问题，提供一种黑枣果醋的制备方法。将黑枣汁添加果胶酶、淀粉酶和纤维素酶协同酶解得到黑枣汁；然后再加入酵母菌和乳酸菌共同发酵制成黑枣酒；再经过醋酸菌将黑枣酒发酵为黑枣果醋发酵液；最后经过离心、过滤及灭菌后得到富含琥珀酸的黑枣果醋。多菌种发酵制得的黑枣果醋中总酸以醋酸计含量≥4.5g/100ml，琥珀酸含量≥16g/l，琥珀酸含量大大提高，使得黑枣果醋口味更鲜，口感更柔和、绵长。