本发明实施例提供一种基于耦合表示的作物育种评价方法及装置，该方法包括：构建作物育种评价数据集，数据集中的每个数据单元包括育种个体的性状特征集合T以及实验结果；对所有性状特征集合T进行预处理；将所有性状特征均进行预设位数L的指数扩充，形成TL；根据TL建立每个性状与TL中所有性状特征的耦合关系矩阵，确定每个性状对应的L个耦合特征，并根据所有性状的耦合特征，构建性状耦合特征集合TC；基于TC并以实验结果为标签，进行耦合特征选择，得到分类准确率最高的耦合特征子集TS，使用TS构建育种评价模型进行育种评价。该方法可有效描述作物性状表现间的耦合关系，解决作物各性状表现非独立同分布带来的评价效果偏置。