本发明提供一种计算机联锁轨道停电故障防护方法、装置及系统，该防护方法包括记录锁闭进路中多个轨道电路区段内的轨道电路信息，当某一轨道电路区段的继电器动作顺序满足列车在运行方向上走行的三点检查逻辑时，判断该轨道电路区段、以及相邻的轨道电路区段的区段状态是否为非正常状态变化，若是，则不允许本轨道电路区段解锁，否则允许本轨道电路区段解锁。本发明的防护方法无需另外增加硬件零散设备，直接通过轨道电路区段内继电器的动作时间点判断进路中各轨道电路区段是否处于非正常状态变化，并结合三点检查，综合轨道电路区段的解锁条件，防止了进路内轨道电路区段状态异常下的错误解锁，以此来保证行车安全和人身财产安全。