本发明公开了一种聚能射流破岩与流态化运载系统及方法，包括脉冲聚能射流掘进机、水石分离系统、石料破碎系统、石料泵送系统以及充填采煤液压支架，脉冲聚能射流掘进机包括脉冲聚能射流发生系统、装载部、转运部、行走部；本发明简单易实施，采用脉冲聚能射流掘进机破碎岩石，可以提高岩石破碎效率，降低粉尘量，采用流态化技术对水石混合物运载，提高岩石巷道掘进效率，将碎石直接输送至煤矿采空区充填，可以有效降低地面塌陷，降低采空区充填成本，提高煤矿巷道掘进效率。