本发明公开了一种基于FFT的脉间频率捷变雷达的目标速度估计方法，主要解决现有脉间频率捷变雷达进行目标速度估计时计算量大、耗时久的问题。其实现方案是：随机生成脉间频率捷变雷达的跳频频点；按生成的跳频频点顺序发射和接收脉间频率捷变雷达回波；通过正交下变频获得回波基带复信号；对基带复信号做脉冲压缩处理；根据雷达系统速度检测范围和检测精度生成速度补偿向量组；对脉冲压缩矩阵按列进行速度补偿处理；用基于FFT的方法选取最佳速度补偿结果；根据最佳速度补偿结果得到目标速度的估计。本发明相比现有的最大相关法大大减少了计算量、节省了硬件计算资源，提高了信号处理实时性，可应用于脉间频率捷变雷达目标检测。