本发明属于数据采集技术领域，具体涉及基于数据整合的政府财政数据采集系统及数据采集方法。所述系统包括：数据源数据库、存储数据库、数据表格生成单元和数据表格读取单元；所述数据表格生成单元，用于根据选取的数据字段生成对应的数据采集表格；数据采集单元，用于按照生成的数据采集表格对应的格式，从数据源数据库获取数据，得到相应格式的源数据；数据表格读取单元，用于读取源数据，校验源数据，然后将源数据并导入存储数据库。具有智能化程度高、数据误差小和数据处理效率高的优点。