本发明涉及一种摩托车混动控制方法及系统，系统包括发动机、驱动轮和加速器操作件，在发动机的曲轴上连接有辅助动力用的电动发电机，电动发电机由电池供电并具备发电功能，电动发电机所产生的电量用于向所述电池充电；所述的电动发电机连接有电动发电机控制模块并通过电动发电机控制模块控制电动发电机的运行，电动发电机控制模块包括加速数据获取单元、电动发电机控制单元、充电量检测单元、充电单元、发动机旋转速度检测单元和发动机旋转速度推测单元；电动发电机控制单元包括供电限值单元、供电时间设定单元和预备动力旋转单元。本发明可高效地利用发动机的动力，使能量高效利用，降低发动机的油耗。