本发明实施例提供一种自动化条件位置偏好类动物行为实验装置，包括装置主体、阻挡机构、驱赶机构、惩罚机构以及实验控制器，装置主体形成有实验准备区、实验区和奖赏施加区；阻挡机构具有阻挡状态以及释放状态；驱赶机构用于驱赶动物在实验区内活动；惩罚机构用于对实验区内的动物施加惩罚；阻挡机构、驱赶机构和惩罚机构均与实验控制器电性连接。本发明实施例提供的自动化条件位置偏好类动物行为实验装置通过对阻挡机构和驱赶机构的自动控制，能实现对被测动物位置的转换，不需要人工干预；并通过实验控制器在实验前对奖赏和惩罚的施加进行设定，能实现自动多次连续实验，以降低人工干预对实验结果的影响。