本发明公开了一种用于自动充电站的控制系统，其包括工业控制计算机、可编程控制器、六轴机械臂控制器、机械手控制模块、组合定位模块、充电桩、监控模块、安全保护模块和路由器。本发明采用激光位移传感器和视觉定位单元组合确定待充电电动公交车充电插座的位置，应用六轴机械臂带动充电枪机械手，具备自动从充电桩抓取充电枪，并插入待充电电动公交车的充电插座，再控制充电桩启动充电，充电完成后，能自动停止充电，并从待充电电动公交车的充电插座抓取充电枪、拔出充电枪，再送回充电桩的插座，最后进入待机位置，可实现电动公交车充电自动化作业。本发明与传统的人工作业相比，降低了劳动强度，节省了人力资源成本。