本发明涉及甘蔗制糖澄清技术领域，具体公开了一种制糖专用复合酶制剂，包括以下重量百分比成分：右旋糖酐酶40~48%，果胶酶18~25%，纤维素酶8~12%，多酚氧化酶4~6%，木瓜蛋白酶4~6%，氯化镁8~12%，聚二甲基二烯丙基氯化铵3~6%。本发明还提供了制糖专用复合酶制剂的制备方法。将复合酶制剂加入甘蔗压榨汁中进行澄清处理，糖汁的粘度得到较明显的降低，在煮糖过程起到一定的降低粘度效果，有助于蔗糖分子的吸收和结晶，使成品色值下降20~30%，混浊度下降了30%以上，不溶于水杂质降低20~30%，提高简纯度和蔗糖分回收率，减少废糖蜜产量。