本发明公开了一种企业评价模型自定义配置的方法与系统，方法包括：建立指标库；采集数据并存储至数据存储终端；从指标库中调取指标项；从数据存储终端中抽取指标项对应的全量数据；通过条件值设定对全量数据做异常值处理得到指标数据；设定基准值公式、选取标准化公式、将指标数据作为入参分别得到第一和第二企业评价模型入参；配置不同阈值下指标数据的加分值作为第三企业评价模型入参；设置指标项的权重，结合第一、第二和第三企业评价模型入参得到企业的最终评分；根据最终评分对企业进行等级划分，企业评价模型配置完成。通过自定义指标项和数据处理，满足对企业的不同维度不同阶段的评价，可灵活修改模型，降低系统重复开发成本。