本发明属于医药技术领域，具体涉及头孢唑肟钠及其中间体的制备方法，将7‑氨基‑3‑无‑头孢‑4‑羧酸二苯甲酯与(E)‑2‑(2‑氨基噻唑‑4‑基)‑2‑(甲氧基亚氨基)乙酸加入DMF溶液中，加入缩合剂，反应完全后，向反应液中加入水，过滤得头孢唑肟钠中间体滤液，加入酸，调节pH，过滤，干燥，得头孢唑肟酸；将所述头孢唑肟酸悬于水，加入碳酸氢钠溶解后加入活性炭，进行过滤，得滤液加入丙酮，结晶过滤干燥得头孢唑肟钠；本发明方法采用直接缩合并一步法脱去二苯甲酯保护基，工艺安全环保，原料价格低廉，所得头孢唑肟钠质量优于传统工艺。