本发明公开了一株可干预代谢综合征的鼠李糖乳杆菌及应用，尤其是一种能够干预代谢综合征的菌株，其可添加在各种健康食品及保健食品中，属于微生物技术领域。本发明提供了鼠李糖乳杆菌CCFM1146、其组合物、发酵食品、用途、菌剂及其菌剂制备方法，本发明的鼠李糖乳杆菌CCFM1146能显著改善高脂饮食导致的代谢综合征；显著改善代谢综合征小鼠的血糖、葡萄糖耐受量及胰岛素抵抗指数水平；显著改善肠道内微生物丰度，维持结肠屏障结构；显著改善肝脏中促炎因子IL‑6的水平，鼠李糖乳杆菌CCFM1146用于制备缓解代谢综合征、非酒精性脂肪肝、糖尿病等疾病发生的药物组合物与发酵食品，具有非常广泛的应用前景。