本申请涉及一种运营期大跨桥梁涡激振动监测、预警、评价方法及系统，方法包括步骤：构建风速、风向、持续吹佛时间的三维联合概率分布模型，对涡激振动风险进行中长期预警；计算该时间段内涡振不利风况风场条件概率，并进行涡激振动风险短期告警；根据实测振动加速度信号的功率谱密度曲线，提取前两个峰值频率并计算预设区间内的功率谱密度曲线积分，得到频域能量比指标；在限幅振动的情况下，根据频域能量比指标的大小判定桥梁是否发生涡激振动，进而判定涡激振动所属的模态阶次；根据舒适度剩余百分比指标来评价涡激振动对桥梁的影响。本申请提供的运营期大跨桥梁涡激振动监测、预警、评价方法，不仅实现了桥梁涡激振动的在线监测、预警、判定及评价，而且可靠性较好。