本发明涉及到完善微电网电能质量，尤其涉及一种在对储能控制基础上采用APF完善微电网电能质量的方法。包括对目标微电网分析其谐波的情况，并应用并联型有源滤波装置针对性地进行谐波治理，其中补偿装置控制部分采用PR控制算法，谐波测量环节采用Ip‑Iq算法，并采用PRD控制算法补偿谐波电流。其对并联有源滤波器控制方法采用基于比例谐振控制的方法，通过储能系统与有源滤波器的配合实现了微电网运行当中电压谐波、电流谐波等电能质量指标提高。