本发明公开了一种核桃仁微波脱膜及护色工艺，包括如下步骤：筛选青皮核桃，进行微波干燥处理，得到微波干燥后的青皮核桃；步骤二、对微波干燥后的青皮核桃进行机械脱皮，再进行分阶段烘干，得到烘干后的核桃；步骤三、对烘干后的核桃进行机械剥壳，并进行仁壳分离，得到核桃仁与核桃壳；步骤四、对核桃仁进行微波烘焙处理，得到浸泡后的核桃仁；步骤五、将浸泡后的核桃仁喷淋脱去核桃内膜，得到脱膜后的核桃仁；步骤六、将脱膜后的核桃仁进行护色处理，再倒入色选机中进行色选处理，得到破碎、完整发黑、完整棕色、完整白色的共四种级别的核桃仁。该核桃仁微波脱膜及护色工艺，工艺安全，制备便捷。