本发明公开了一种长保质期面包夹心用黑米香菇酱及制备方法与应用。该黑米香菇酱包含黑米香菇饭、变性淀粉、糖醇、甘油、胶体、蔗糖、糖浆、食盐、防腐剂、食用香精和调节pH为4.0～4.5的酸味剂。本发明通过变性淀粉、胶体、乳化剂和糖类的科学组合选择，在蒸米过程中，变性淀粉、羧甲基纤维素钠和酸在高温下糊化并发生反应，在黑米颗粒熟化的过程中同时也与黑米香菇形成一个稳定的体系。该黑米香菇酱可常温保存6个月，应用在夹心类面包产品中，可常温保存3～6个月，仍保持黑米纤维感以及在长保质期面包中保持柔软。