大豆基因GmTCM1及其获得方法与应用，属于大豆遗传育种技术领域。为了提高大豆异黄酮含量，并获得高异黄酮的转基因大豆植株，本发明从高异黄酮含量大豆品种中豆27中克隆出大豆基因GmTCM1，对该基因的生物学信息分析和基因功能的初步分析表明GmTCM1基因能够提高大豆异黄酮的含量，并参与对干旱和盐等非生物胁迫以及核盘菌、疫霉菌和灰斑菌等生物胁迫的抗性反应，此外，得到的转基因材料通过之后的继代繁殖及鉴定，可以成为稳定的抗病遗传材料。本发明对于加速高异黄酮抗病抗逆型大豆新品种的育种进程以及提高育种效率具有重要的理论意义和实践价值。