本发明公开了一种河道污水生态治理装置及其治理方法，涉及污水治理技术领域，解决了现有的河道污水治理装置，效率低下，处理效果也难以保证的问题。包括治理池，治理池一端设有与排污管连通的进水管，另一端设有与河道连通的出水管，治理池内设有若干平行隔板，隔板将治理池内的空间沿进水管到出水管方向依次分隔成若干处理分池，各隔板的上端面低于治理池上端面的最低点；各处理分池内皆设有处理模块，处理模块包括连接于治理池内的软轴，软轴外套设有若干圆柱筒，圆柱筒中空且容纳有污水净化剂，其外壳上设有漏孔，圆柱筒外周连接有若干吸附条。达到了使污水净化剂能够更快的分散到各个处理池中，提高污水净化效率的效果。