本发明公开了一种跨时空能源综合配置优化方法、装置、电子设备及存储介质，本发明所述方法以能源供应总成本最小为目标构建线性规划模型，求解得到发电能源需求总量和结构，作为所述内层优化模型及外层优化模型的边界条件；以各区域不同水平年的运行成本最小为目标构建内层优化模型；以系统供电成本最小为目标构建外层优化模型；对所述内层优化模型及外层优化模型求解得到各类电源装机容量和联网方案。本发明主要围绕跨时空尺度下的能源综合配置优化方法展开，在发电能源平衡层面优化发电能源总量及其结构；在此基础上，考虑发电能源约束，在规划层面实现各区域内电力平衡与跨时空尺度下区域间多能互补。