本发明公开了一种考虑风险因素时变特征的公路事故频次预测方法，其步骤如下：1、采集和处理历史交通事故数据及相关风险因素数据；2、建立Logistic回归模型；3、采用约登指数法计算Logistic模型的分类阈值；4、基于Logistic模型和历史事故数据，计算模型的阳性预测值(Positive predictive value)和阴性预测值(Negative predictive value)；5、利用计算得到的阳性预测值和阴性预测值，进行事故频次预测。本发明能克服传统事故频次模型无法反映风险因素的时变特征对事故的影响的问题，有利于提高事故频次预测方法的预测精度。