本发明提供了一种高盐榨菜废水处理系统，包括依次布置的高盐榨菜废水预处理装置、电渗析器、UASB反应器，在高盐榨菜废水预处理装置中对循环反应池中悬挂填料上的嗜盐复合菌进行强化，使填料表面附着生长的复合菌剂和悬浮生长的活性污泥的两种微生物能在系统中共存，去除榨菜废水中大部分的有机物和氨氮，净化后的废水再通过沉淀池进一步对悬浮物进行去除，为电渗析器减轻负荷，提高了处理效率并减低了运行成本，采用本发明对高盐榨菜废水进行处理，微生物浓度高、抗冲击负荷能力强、处理有机负荷高、生物脱氮除磷能力强、预处理效果好、工程投资和运行费用低。