本发明提供一种适用于双线盾构始发和出渣运料的隧道结构及其施工方法，包括：用于第一线盾构机吊运组装的工作井第一始发井；设置于第一始发井后侧沿纵向延伸的第一联络通道；设置于第一联络通道尾部的第一后出渣运料口；与第一始发井平行设置的第二始发井，其用于第二线盾构机吊运组装的工作井；设置于第二始发井后侧沿纵向延伸的第二联络通道；设置于第二联络通道尾部的第二后出渣运料口；设置于后出渣运料口后侧的反向出渣导洞，其为第二线整机始发及运行提供足够长度轨道；利用第一始发井、第一联络通道和后出渣运料口进行盾构分体始发；利用第二始发井、第二联络通道、后出渣运料口及反向出渣导洞进行盾构整机始发。本发明实现小尺寸始发井双线盾构始发及出渣运料，施工方便，提高了经济效益。