本发明提供了基于地质钻孔的松散承压含水层渗透系数确定方法，方法包括：收集地质钻孔信息与数据；确定渗透系数的影响因素；将各影响因素与已有现场抽水试验获取的渗透系数进行相关性分析和偏相关性分析，选择出关键影响因素；将各关键影响因素进行随机组合，并进行多元线性回归分析，进行拟合优度检验和方程显著性检验，并排序；根据排序结果确定目标回归方程；将煤矿已有地质钻孔信息与数据代入目标回归方程，确定其松散承压含水层渗透系数。本发明将数学手段运用于工程实践，能够充分利用已有的煤矿地质钻孔信息与数据，对研究松散层渗透系数的各向异性与区域效应，以及矿井突水等水文地质灾害的防治提供技术支持。