本发明公开了一种用于杂交水稻制种机械的气力式分禾器及其分禾方法，包括共同构成刚性结构的导向段、过渡段和分禾段；导向段的工作端为用于插入父本植株与母本植株底部之间的锥形圆滑结构，连接端通过过渡段平滑过渡连接分禾段；分禾段为向上倾斜的中空直管，上部均匀开设若干向内部延伸的导流管；导流管的一端与分禾段的中空内腔连通，另一端与外界连通；分禾段的内部同轴固定有用于通入气体的混流管；混流管的进气端外接用于连接鼓风机的进气管，底部均匀开设若干气流孔。本发明实现了父本与母本植株无损、柔性的彻底分离，避免了授粉机械对植株的损伤、种子收获机误收割父本穗影响种子纯度，提高杂交水稻制种授粉和收获作业质量。