本发明提供一种异形烟叶智能剪切系统，包括：视觉检测设备、剪切机床、分拣设备和工控机。工控机分别与视觉检测设备、分拣设备和剪切机床信号连接。视觉检测设备设置在所述剪切机床侧边，用于对剪切机床上的烟叶进行烟叶图像采集，并根据所述烟叶图像确定烟叶的视觉三维坐标。工控机设置有图形排版程序，以对所述烟叶图像进行剪切图形排版设计，并根据所述排版设计控制所述剪切机床对烟叶进行剪切。工控机设置有图像识别处理程序，以对所述烟叶图像进行烟叶外观和烟梗识别，进而控制分拣设备根据识别结果和所述视觉三维坐标对剪切后的烟叶和烟梗进行分拣。本发明能提高烟叶剪切和分拣的工作效率，降低生产成本。