本发明公开了一种水解生淀粉的方法及其应用，属于基因工程以及微生物工程技术领域。本发明提供了一种降解效率高的水解生淀粉的方法，此方法为将氨基酸序列如SEQ ID No.1所示的糖化酶与α‑淀粉酶共同添加至含有生淀粉的反应体系中；利用此方法，将氨基酸序列如SEQ ID No.1所示的糖化酶与中温α‑淀粉酶分别以0.1U/mg生淀粉和0.1U/mg生淀粉的加酶量协同添加至含有生淀粉的反应体系中，于温度为50℃的条件下水解24h，即可使反应体系中生淀粉的降解率高达96.93％。