本发明公开了一种调节棉花生长提高抗逆性组合物及其制备方法与应用。该组合物包括冠菌素和甲哌鎓。所述冠菌素和甲哌鎓的重量比为0.0001～0.01：1～20。该组合物搭配科学且配比合理，不仅能调整棉花株型，且具有多种抗逆活性。经过室内试验证明，本发明的组合物对棉花具有很好的控旺及抗逆效果。该植物生长调节剂能调节棉花株型，避免人工打顶，提高棉花的抗低温和干旱活性，有效降低了劳动力的投入，同时能避免棉花苗期仅仅喷施甲哌鎓容易造成僵苗、棉花减产风险等负面影响。