本发明公开了一种发动机ECU刷写方法、装置及系统，所述方法包括：获取待刷写车辆的发动机数据；根据发动机数据调取项目维护数据后，将项目维护数据发送至自动标定装置，以使自动标定装置根据项目维护数据获取配置数据；接收自动标定装置发送的配置数据，根据配置数据调取ECU代码数据，并将ECU代码数据发送至自动标定装置，以使自动标定装置根据ECU代码数据对待刷写车辆的发动机ECU进行刷写。采用本发明实施例能降低数据维护成本，提高发动机ECU刷写的安全性。