本发明公开了一种码垛式清洗架立体库，包括框架机构和设于框架机构内的码垛机构，码垛机构包括可沿Z轴方向运动的Z轴传动机构、可沿Y轴方向运动的Y轴传动机构和可沿X轴方向运动的X轴传动机构，Z轴传动机构设于Y轴传动机构上，Y轴传动机构设于X轴传动机构上。上述码垛式清洗架立体库，可以充分利用框架机构的高度空间，从而可以实现清洗架的立体存储，有利于在保证存储能力的基础上节约占地面积；此外，通过码垛机构实现三维立体运动，且三个方向的运动相互独立，互不干涉，可以保证稳定安全的存取工作，同时无需人工搬运，从而可以降低工人的劳动强度和提高消毒供应中心物流工作的效率。