本申请公开了一种用于灵长类动物种群行为分析的个体间距自动计算方法、装置及计算机可读存储介质。其中，方法包括预先基于深度学习算法训练得到用于对输入的待处理图像组中的各图像所包含的目标进行目标识别并输出目标相应位置信息的目标识别模型。将双目摄像头输出的左右两目图像进行统一坐标系处理，得到待处理图像组；将待处理图像组输入至目标识别模型，得到目标分别在待处理图像组中左右两目图像的位置信息。根据目标在左右两目图像的位置信息计算视差信息，并通过双目摄像头的内部参数和外部参数计算视差信息对应的三维坐标信息，最后基于各目标的三维坐标信息进行测距计算，有效提高生物种群各生物个体之间的间距计算效率。