本发明公开了一种耦合煤电的低温多效海水淡化系统最佳热源确定方法及系统，给定外供电负荷和制水负荷，以增设海水淡化系统静态投资回收期最低为目标函数，根据原海水温度平均值、总制水负荷、总供电负荷平均值以及各热源方案蒸汽参数等边界参数，进行海水淡化系统及热源系统的方案设计及投资确定，在总平均供电负荷和总制水负荷双变量约束下，计算得出各热源方案供电煤耗值。以投资最小的热源方案为对比基准，其他热源方案与基准热源进行供热煤耗值对比：若大于，该热源不能作为最优方案；若小于，则选取静态回收期最小值对应的方案，作为最佳热源。本发明以静态投资回收期最低为目标函数，获取最佳热源，实现运行成本最低和盈利能力最大化。