本发明提供一种基于飞秒激光器的光纤端面的加工方法，属于光纤制备技术领域，设定飞秒激光器的波长、脉冲宽度、重复频率以及能量，飞秒激光对光纤端面进行融化，至呈水滴形态，冷却；开启飞秒激光器，调整飞秒激光器的波长、脉冲宽度、重复频率以及能量，飞秒激光对水滴型光纤端面的上表面处进行处理，控制加工平台的移动，实现阶梯型光纤端面；将光纤取下，使用氢氟酸溶液进行浸泡，得到最终制备好的光纤。本发明利用飞秒激光的超短脉冲对光纤端面直接进行加工，使得材料融化形成所需要的基础结构，利用飞秒激光的重复频率及能量等参数的可调性，形成融化成型与加工为一体的加工工艺，制作出了质量更高的光纤端面结构。