本发明公开了一种双通道轴系横向振动主动控制装置，该装置包含：加速度传感器一、二和三；振动控制器；信号放大器一、二和三；功率放大器一和二；电磁作动器一和二；以及作动器支架。其中，电磁作动器一、二通过作动器支架与中间轴承座连接，加速度传感器一、二和三分别将测得的振动加速度电信号传输至信号放大器一、二和三进行放大，经信号放大器一、二和三传输至振动控制器，振动控制器进行频谱分析和特征信号提取后获得振动信息；加速度传感器三提取轴系振动信号作为参考信号，电磁作动器一、二产生与轴系振动频率大小相同，方向相反的力用于抵消轴系振动，实现对多个方向的轴系横向振动的控制。