本发明提供能够更恰当地控制使由燃料电池发出的电力消耗的辅机的动作的控制系统、移动体及控制方法。实施方式的控制系统具备通过阳极和阴极来发电的燃料电池、能够积蓄由所述燃料电池发出的电力的蓄电装置、能够被供给所述电力的辅机、以及控制所述燃料电池及所述辅机的动作的控制部，所述控制部根据所述燃料电池发电时所述蓄电装置的蓄电状况，控制为由所述辅机消耗所述电力，并基于与所述辅机相关的温度信息，来调整对由所述辅机消耗的电力进行抑制的时机及进行抑制的程度中的一方或双方。