本发明属于电子对抗中雷达辐射源识别技术领域，公开了一种未知雷达辐射源个体识别方法及系统，对接收到的雷达辐射源信号进行模糊函数掩模特征提取；将模糊函数掩模特征输入至深度稀疏自编码器进行特征提取；并将提取到的特征分子集输入至基于支持向量数据描述的集成异常检测器；将多个分布式深度学习异常检测器的结果进行基于Jousselme证据距离的决策融合，最终识别出未知雷达辐射源。系统包括：未知雷达辐射源个体的智能表征模块；基于稀疏自编码器的深层特征提取模块；基于支持向量数据描述的识别模块；基于Jousselme证据距离的决策融合模块。本发明实现了复杂电磁环境下未知雷达辐射源个体的智能识别。