本发明一种自动上料压合医用肝素帽组装机，设置有机架和控制器，机架上设置有转盘，转盘采用高精度凸轮分割器作为驱动装置，机架上沿转盘的转动方向顺次设置有壳体上料工位、胶帽上料工位、第一预热工位、第一压合工位、第二预热工位、第二压合工位、视觉检测工位、良品出料工位、不良品出料工位，肝素帽壳体、胶帽分别由壳体上料工位、胶帽上料工位上料，由第一预热工位、第二预热工位对初步组装的肝素帽进行预热，预热完成后由第一压合工位、第二压合工位进行压合，压合时将肝素帽移动到压合平台上进行压合，保证了压合质量，视觉检测工位对压合后的肝素帽进行检测，检测合格的由良品出料工位出料，检测不合格的由不良品出料工位出料。