本发明提供一种公猪预测受胎率计算方法及应用，涉及动物遗传育种技术领域。该方法包括：确定影响效应，所述影响效应包括公猪近交系数、后代近交系数、公猪配种时月龄和公猪个体随机效应；根据所述影响效应，建立评价模型，计算公猪近交系数的回归系数、后代近交系数的回归系数、公猪配种时月龄的效应值和公猪个体随机效应的效应值；根据计算结果，计算公猪的预测受胎率。该预测受胎率可作为评估公猪繁殖性能的依据，用于判断群体中公猪繁殖性能的优劣，因而可根据该预测受胎率区别不同繁殖性能的公猪，便于淘汰繁殖性能低的公猪，降低生产成本。该方法计算简便，对混合品种公猪与单一品种公猪均能实现较好的分类效果。