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公开(公告)号：CN118071019B
公开(公告)日：2024-08-27
申请号：CN202410240896.4
申请日：2024-03-04
申请人： 云南大学
IPC分类号： G06Q10/063 , G06Q50/26 , G16B10/00 , G16B40/00 , G01N33/24
摘要： 本发明公开了一种基于退化生态区的生物多样性恢复协同优化调控方法，涉及退化生态区优化调控技术领域，包括以下步骤：将退化生态区划分为若干个子区域，并将子区域进行初始编号，生成初始子区域管理列表，对整个退化生态区进行分区管理；将每个划分后的子区域再次划分为若干个子子区域，并将划分后的子子区域进行顺序编号。本发明通过对子子区域内土壤和植物信息的处理与分析，生成优化调控隐患指数，通过优化调控隐患指数对退化生态区生物多样性恢复协同优化调控实时监控和评估，决策者可以有针对性地采取措施，调整土壤条件、植物群落结构，以及进行必要的生物多样性引入，最终实现生态系统的恢复与协同优化调控。
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公开(公告)号：CN111564180B
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202010397964.X
申请日：2020-05-12
申请人： 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要： 发明涉及一种鮡科鱼类古染色体进化比较分析的方法，使用比较基因组技术对鮡科鱼的古染色体进行分析，对其染色体的进化研究有利于摸清其基因组的进化规律，为鮡科鱼的进化研究和资源保护提供基本的数据。本发明提出的方法包括黑斑原鮡染色体序列构建、系统发育分析、近缘物种染色体比较和古染色体构建等步骤，适用于西藏鮡科鱼类，可广泛应用于青藏高原鮡科鱼的资源调查和保护研究。
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公开(公告)号：CN118412044A
公开(公告)日：2024-07-30
申请号：CN202410621650.1
申请日：2024-05-17
申请人： 浙江大学
摘要： 本发明公开了一种用于纯合多亲本高世代互交群体的QTL定位方法，包括以下步骤：(1)遗传效应的正交分解；(2)亲本来源概率矩阵的构建；(3)统计遗传模型的建立；(4)QTL定位及其遗传参数估计。与现有技术相比，本发明利用正交分解的方法将加性方差与加加上位性方差分解，提高了QTL的定位功效，降低了假阳性率；与现有不含上位性和基因与环境互作效应的MAGIC群体QTL定位和遗传参数估计模型相比，本发明提出的模型包含了加加上位性效应、环境互作效应，更符合复杂性状的遗传特征，更能有效地解析复杂性状的遗传结构；本发明提出的混合线性模型灵活性高，极易将模型和分析方法拓展到更多亲本及任意世代的MAGIC群体。
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公开(公告)号：CN118256644A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202410420213.3
申请日：2024-04-09
申请人： 河北省林业和草原科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B30/10 , G16B10/00
摘要： 本发明公开一种鉴定白榆与榔榆种质的分子标记及其应用，所述分子标记为下列引物对为Ulmus_p104或/和Ulmus_p40，采集待测白榆或榔榆新鲜组织样本，提取组织样本DNA；以该DNA为模板，使用所述分子标记进行PCR扩增；电泳检测扩增产物；根据检测结果判定待检样本为白榆或榔榆。本发明利用转录组测序的SSR分子标记鉴定白榆与榔榆种质资源，有利于促进白榆与榔榆良种选育，加快优良种质的利用进程。本发明特异性引物分别对榔榆和白榆组织进行扩增，两者产物长度差异显著，表明这些特异性引物能够有效鉴定白榆与榔榆种质。
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公开(公告)号：CN117858944A
公开(公告)日：2024-04-09
申请号：CN202280052061.5
申请日：2022-05-25
申请人： 纳米科学研究合作协会中心
发明人： R·佩雷兹-希门尼斯 , B·阿隆索-莱尔马
摘要： 本发明涉及使用系统发育祖先序列重建来产生具有改进能力的新Cas酶。通过这种策略，已经获得了当前现有种的Cas9蛋白的祖先变体，其可以表现出与核酸内切酶活性分开的切口酶活性，并且放宽(如果不是废除的话)PAM要求。还观察到使用来自多个现有细菌种的Cas9 gRNA的tracrRNA组分的能力。
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公开(公告)号：CN117821646A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202410004521.8
申请日：2024-01-03
申请人： 中国科学院昆明植物研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B20/20 , G16B30/20 , G16B50/10 , G16B30/10 , G16B10/00
摘要： 本发明公开了一种基于ITS序列鉴定灯台叶的方法，属于生物技术领域，本发明的方法包括以下步骤：一：基因组DNA提取；二：测序；三：对ITS序列原始测序数据进行过滤、组装、拼接和注释；四：网上下载ITS序列；五：构建样品的ITS序列邻接树；六：根据邻接树判断。该发明相较于传统形态学鉴定，仅需ITS基因片段即可准确鉴定物种，简化了流程。方法迅速、高效、耗时短、重复性好，具备高度稳定性。实验过程标准，操作简便，易实现物种鉴定自动化，解决了分类鉴定人才匮乏问题，提高效率。特别对于灯台叶分子鉴定，ITS序列适用性强，鉴定率达100%，显著提升了中药灯台叶鉴定成功率。这项技术不仅节省时间、省力，也为中药鉴定领域带来了重大突破。
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公开(公告)号：CN117821645A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202410004520.3
申请日：2024-01-03
申请人： 中国科学院昆明植物研究所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B20/20 , G16B30/20 , G16B50/10 , G16B30/10 , G16B10/00
摘要： 本发明公开了一种基于ITS序列鉴定灯盏花的方法，属于生物技术领域。本发明的方法包括以下步骤：一：基因组DNA提取；二：基因组浅层测序；三：对ITS序列原始测序数据进行过滤、组装、拼接和注释；四：网上下载ITS序列；五：构建样品的ITS序列邻接树；六：根据邻接树判断。本发明的优点在于采用DNA分子鉴定技术，相比传统的形态学鉴定方法具有多个显著优势。本发明的优点包括采用DNA分子鉴定技术、快速有效、耗时短、重复性好、高鉴定率、省时省力和高效率等。这些优势使得中药灯盏花的鉴定更加准确、便捷和可靠，为中药材的质量控制和资源保护提供了重要的科学支持，具有广泛的应用前景和社会价值。
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公开(公告)号：CN117126952A
公开(公告)日：2023-11-28
申请号：CN202311067003.2
申请日：2023-08-23
申请人： 扬州大学
摘要： 本发明属于微生物分型技术领域，提供了一种副鸡禽杆菌MLST分子分型的引物组及其应用，首次建立了使用多位点序列分型系统(MLST)对副鸡禽杆菌进行分子分型的操作技术。本发明通过7个管家基因筛选、扩增、检测与测序，采用SnapGene软件对测序结果进行多序列比对与分析，获得菌株序列型(ST)，绘制系统发育树和聚类分析。本分型技术所使用的7个管家基因组合、扩增引物均为首次采用，PCR反应体系和条件为自行优化。该技术流程可以用于副鸡禽杆菌MLST分型，揭示副鸡禽杆菌菌株间等位基因的多样性、溯源和流行病学监测。
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公开(公告)号：CN116935949A
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202210365072.0
申请日：2022-04-07
申请人： 中国计量大学
摘要： 本发明提供了一种基于转录组快速获取无基因组物种的目标基因家族的方法，通过选取参照物种、系列模式物种，并基于目标转录组数据，组合使用基因搜索比对软件Bioedit、进化树构建软件MEGA6和在线分析软件MEME，构建了一种可视化、不需要专业的生物信息学知识，也无需使用R语言等软件平台、运算代码撰写的，针对无基因组物种，快速、高效、准确、全面地获取目标基因家族的所有序列的方法。本发明采用该方法成功获得杭白菊的PEBP基因家族所有序列，并经一代测序验证，准确率为100％。
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公开(公告)号：CN116913393A
公开(公告)日：2023-10-20
申请号：CN202311172259.X
申请日：2023-09-12
申请人： 浙江大学杭州国际科创中心
摘要： 本说明书实施例提供一种基于强化学习的蛋白质进化方法，方法包括：获取各样本蛋白质的特征信息，根据各样本蛋白质的特征信息构建蛋白质变异生成模型和评估模型；由蛋白质变异生成模型在初始蛋白质基础上得到一组变异蛋白质；每得到一组变异蛋白质，使用评估模型评估最新得到的该组变异蛋白质中各变异蛋白质的适应度，并判断适应度是否满足预设条件；若适应度不满足预设条件，则根据最新得到的该组变异蛋白质中各变异蛋白质的适应度对蛋白质变异生成模型进行强化学习，并由经强化学习后的蛋白质变异生成模型，在最新得到的变异蛋白质基础上得到新的一组变异蛋白质；若适应度满足预设条件，则从最新得到的该组变异蛋白质中得到目标进化蛋白质。
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