本发明提供了一种微生物油脂冬化分提的方法。该微生物油脂冬化分提的方法包括如下步骤：1)向ARA脱溶油中加入三饱和脂肪酸甘油酯后冬化，所述ARA脱溶油与所述三饱和脂肪酸甘油酯的质量比为2:1～1.25:1；所述三饱和脂肪酸甘油酯中饱和脂肪酸的占比不低于90％；2)板框过滤分提。本发明提供的微生物油脂冬化分提方法可以在短时间内使ARA脱溶油中形成大量且稳定性好的晶型，可较长时间保持颗粒形态，便于有效分离，ARA脱溶油经一次冬化分提就能获得低温下澄清透亮的油脂产品，且该方法使用的是常用的冬化分离设备，可重复循环使用，用时少，适合大规模生产。