本发明属于致敏原检测领域技术领域，具体涉及一种利用微流控芯片检测水产品致敏原的方法，包括制作仿生超浸润界面材质的第一载体；制作PDMS材质的第二载体；在第一微流道进口加入与彩色荧光微球孵育的一定浓度的甲壳类原肌球蛋白和一定浓度的鱼类小清蛋白的混合液滴，从第一载体下表面向上照射近红外光，近红外光沿第一微流道方向移动，驱动混合液滴沿第一微流道进入微腔室的薄膜。本发明采用仿生超浸润界面材质的第一载体具有近红外响应能力，通过近红外切换仿生超浸润界面的亲疏水性，改变液滴的附着状态，达到操纵液滴的目的；通过待测样品中目标蛋白与设置有荧光标记的蛋白核酸适配体特异性结合，有效检测出食物中是否含有水产品致敏原。