本发明提供了一种混合可再生能源系统的结构优化方法及装置，该方法包括：获取混合可再生能源系统的负荷需求及供电能力要求；建立混合发电子系统的输出功率模型；建立储能发电子系统的氢气燃料箱的数量模型；基于混合可再生能源系统的结构参数，以系统年度总成本为目标构建混合可再生能源系统的目标函数模型；基于负荷需求、供电能力要求、输出功率模型及氢气燃料箱的数量模型，确定结构参数对应的结构参数范围；在结构参数范围内，计算目标函数模型的最优解，确定混合可再生能源系统的结构设计方案。实现了混合可再生能源系统的最佳单位规模方案，在满足系统可靠性的情况下减少整个系统中的年度总成本，提高了混合可再生能源系统的经济性能。