本发明公开了一种含有环孢素的组合物及其在制备治疗干眼症药物中的应用，含有环孢素的药物组合物为由载体中链脂肪酸甘油三酯和环孢素组成的溶液，动物试验证明，所述的含有环孢素的药物组合物，对于干眼症有良好的治疗效果，能够用于治疗干眼症。本发明促进环孢素向眼睛角膜和结缔组织中渗透，延长其保留时间，在保持药物有效浓度的同时减少对眼睛的剌激。本发明的目的还可避免在局部给药后可能出现的视力模糊的问题。本发明还涉及环孢素滴眼液的绿色生产工艺，降本增效，且能延长在应用前的保质期。